Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CARMIL3Q8ND23 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms