Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD8

Prap1, Proline-rich acidic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prap1Q80XD8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prap1Q80XD8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prap1Q80XD8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms