Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1cQ7TSF0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms