Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms