Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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RYR3Q15413 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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RYR3Q15413 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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RYR3Q15413 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RYR3Q15413 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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