Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms