Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RargP18911 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RargP18911 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RargP18911 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RargP18911 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RargP18911 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RargP18911 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms