Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARBP10826 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARBP10826 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RARBP10826 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARBP10826 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms