Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCAO15360 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FANCAO15360 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FANCAO15360 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
FANCAO15360 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
FANCAO15360 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCAO15360 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCAO15360 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCAO15360 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCAO15360 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms