Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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