Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms