Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms