Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TPRNQ4KMQ1 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TPRNQ4KMQ1 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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