Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms