Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
EXT1Q16394 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EXT1Q16394 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms