Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms