Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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