Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms