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| BRD3 | Q15059 | AC115115.1-201 | ENST00000449927 | 248 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA84-201 | ENST00000459229 | 133 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | HMGB1P30-201 | ENST00000492455 | 606 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| BRD3 | Q15059 | C6orf10-202 | ENST00000375015 | 2173 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004944.1-201 | ENST00000517807 | 3059 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| BRD3 | Q15059 | DCUN1D1-208 | ENST00000632685 | 3147 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.85 | | |
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| BRD3 | Q15059 | GTF2IP13-201 | ENST00000438487 | 386 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATP2B2-IT1-201 | ENST00000440152 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNU5F-8P-201 | ENST00000515941 | 111 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
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| BRD3 | Q15059 | SNORA40.12-201 | ENST00000516329 | 111 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU1-107P-201 | ENST00000516617 | 154 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | SCARNA11.3-201 | ENST00000517276 | 130 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC025678.1-201 | ENST00000567861 | 338 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL354950.2-201 | ENST00000617939 | 290 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC012442.3-202 | ENST00000636742 | 206 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL392088.2-201 | ENST00000637607 | 285 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | N4BP2L2-211 | ENST00000504114 | 2513 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | CCDC66-201 | ENST00000326595 | 3027 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | C18orf54-202 | ENST00000382911 | 4056 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL353743.1-202 | ENST00000431724 | 1695 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004520.1-201 | ENST00000608362 | 1413 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | PLS1-201 | ENST00000337777 | 3755 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006020.1-201 | ENST00000420179 | 1854 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZBED5-201 | ENST00000413761 | 2512 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTND5P1-201 | ENST00000445440 | 1375 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | DNAH12-208 | ENST00000495027 | 12146 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | DPY19L2P1-203 | ENST00000458672 | 3347 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | PHF6-201 | ENST00000332070 | 4759 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU1-100P-201 | ENST00000365255 | 165 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR34A-201 | ENST00000385130 | 110 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | PTMAP2-201 | ENST00000397627 | 327 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | CALM2P3-201 | ENST00000400429 | 449 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6ATAC34P-201 | ENST00000408879 | 121 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATP5A1P2-201 | ENST00000412323 | 255 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | UBE2V1P10-201 | ENST00000414685 | 269 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL353705.1-201 | ENST00000433468 | 480 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073063.1-201 | ENST00000434352 | 607 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL157937.1-201 | ENST00000435092 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | CST9LP2-201 | ENST00000437612 | 320 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z96811.1-201 | ENST00000445880 | 108 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | PSPHP1-201 | ENST00000450062 | 261 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | CACYBPP2-201 | ENST00000453625 | 678 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL133351.1-201 | ENST00000456189 | 417 nt | TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005062.1-201 | ENST00000457921 | 566 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | SRRM1P2-201 | ENST00000464531 | 1192 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR892C-201 | ENST00000516410 | 77 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-56P-201 | ENST00000516986 | 93 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZDHHC20P3-201 | ENST00000531576 | 336 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022880.1-201 | ENST00000534017 | 973 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | HIF1AP1-201 | ENST00000553642 | 175 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC018904.1-201 | ENST00000560594 | 542 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR1254-2-201 | ENST00000579553 | 63 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL137843.1-201 | ENST00000605078 | 385 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC019176.2-201 | ENST00000611579 | 315 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | USP12-203 | ENST00000620323 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | TEX41-300 | ENST00000631048 | 69 nt | TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | CHD9-213 | ENST00000564845 | 11504 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR133A1HG-202 | ENST00000581072 | 4226 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | KCNIP4-207 | ENST00000509207 | 1301 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | AK9-201 | ENST00000285397 | 2566 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | SPAG11A-202 | ENST00000326625 | 445 nt | TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| BRD3 | Q15059 | EDDM3A-201 | ENST00000326842 | 927 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |