Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms