Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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