Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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