Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms