Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms