Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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PKP1Q13835 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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PKP1Q13835 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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PKP1Q13835 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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PKP1Q13835 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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PKP1Q13835 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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PKP1Q13835 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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