Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
APOFQ13790 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
APOFQ13790 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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APOFQ13790 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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APOFQ13790 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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