Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ATP1A4Q13733 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms