Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTCH1Q13635 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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PTCH1Q13635 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTCH1Q13635 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTCH1Q13635 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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