Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
MTMR3Q13615 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MTMR3Q13615 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms