Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
C1orf61Q13536 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C1orf61Q13536 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms