Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms