Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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IFT88Q13099 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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IFT88Q13099 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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IFT88Q13099 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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