Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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PRDM2Q13029 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
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PRDM2Q13029 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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PRDM2Q13029 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PRDM2Q13029 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
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