Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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GRIK2Q13002 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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GRIK2Q13002 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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