Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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