| CNTN1 | Q12860 | FSBP-201 | ENST00000481490 | 1158 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SRI-210 | ENST00000490437 | 570 nt | TSL 2 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL39P36-201 | ENST00000490784 | 156 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | PTPRG-AS1-210 | ENST00000498655 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC105252.1-201 | ENST00000503089 | 286 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC023794.1-201 | ENST00000504210 | 403 nt | TSL 2 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC093831.1-201 | ENST00000509166 | 434 nt | TSL 3 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC093206.1-201 | ENST00000515364 | 497 nt | TSL 3 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-677P-201 | ENST00000516914 | 101 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNA5SP165-201 | ENST00000517142 | 115 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | HTN3-202 | ENST00000526767 | 578 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | OR5B19P-201 | ENST00000531766 | 928 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | HOMER1-205 | ENST00000535690 | 642 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP000462.3-201 | ENST00000545593 | 330 nt | TSL 5 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC073591.1-201 | ENST00000552736 | 597 nt | TSL 3 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC027807.1-201 | ENST00000559921 | 996 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR3611-201 | ENST00000584484 | 83 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ZNF626-204 | ENST00000612591 | 4404 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ECT2-211 | ENST00000441497 | 2825 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | PCM1-222 | ENST00000524226 | 5955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LIPI-203 | ENST00000536861 | 1529 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | DEFB114-201 | ENST00000322066 | 253 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-884P-201 | ENST00000363889 | 107 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU4-40P-201 | ENST00000364351 | 143 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | BCL2L15-203 | ENST00000393320 | 276 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | DEFB108C-201 | ENST00000400154 | 252 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR888-201 | ENST00000401186 | 77 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU2-39P-201 | ENST00000410604 | 198 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | BTF3L4P1-201 | ENST00000413813 | 468 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC062039.1-201 | ENST00000414394 | 565 nt | TSL 2 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC092809.3-201 | ENST00000415453 | 231 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AF241725.1-201 | ENST00000416182 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC007463.1-201 | ENST00000416534 | 734 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ABCC5-AS1-201 | ENST00000422946 | 469 nt | TSL 2 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP001117.1-201 | ENST00000428205 | 609 nt | TSL 2 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SAR1AP4-201 | ENST00000429225 | 591 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL592045.1-201 | ENST00000429867 | 352 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC005160.1-201 | ENST00000432405 | 381 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL36AP53-201 | ENST00000432891 | 316 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL591212.2-201 | ENST00000433923 | 257 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC007179.2-207 | ENST00000435557 | 556 nt | TSL 4 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC093579.1-201 | ENST00000439455 | 352 nt | TSL 2 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SFTA1P-203 | ENST00000446372 | 693 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC079448.1-201 | ENST00000449377 | 373 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTCYBP1-201 | ENST00000454315 | 1119 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPS3P1-201 | ENST00000456781 | 192 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTCO2P18-201 | ENST00000457151 | 658 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC093899.1-201 | ENST00000457984 | 376 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU7-23P-201 | ENST00000459465 | 62 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC004052.1-202 | ENST00000505680 | 516 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC008892.1-201 | ENST00000511861 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | PANCR-202 | ENST00000513690 | 448 nt | TSL 2 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNA5SP76-201 | ENST00000516277 | 87 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNA5SP148-201 | ENST00000516527 | 94 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-430P-201 | ENST00000517078 | 107 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP002963.1-201 | ENST00000530590 | 184 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC007619.1-201 | ENST00000544086 | 412 nt | TSL 5 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL135746.1-201 | ENST00000554205 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC126407.1-201 | ENST00000563044 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC141273.1-201 | ENST00000565300 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC008741.1-201 | ENST00000569456 | 510 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR4635-201 | ENST00000583759 | 79 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR4298-201 | ENST00000584380 | 73 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC245008.1-201 | ENST00000608123 | 476 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC008498.1-201 | ENST00000613012 | 531 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC130324.3-201 | ENST00000614165 | 542 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC243829.7-201 | ENST00000633081 | 225 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SIRT1-202 | ENST00000403579 | 3333 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | PRKG2-206 | ENST00000545647 | 3852 nt | TSL 5 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CCDC82-202 | ENST00000423339 | 1878 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CDK1-202 | ENST00000373809 | 1613 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | EBAG9-210 | ENST00000620557 | 2186 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | PLCZ1-209 | ENST00000539875 | 1398 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | OR4K2-204 | ENST00000641885 | 8681 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | VTRNA1-1-201 | ENST00000363120 | 99 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNA5SP126-201 | ENST00000365092 | 109 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | TSHB-202 | ENST00000369517 | 474 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | DEFB119-202 | ENST00000376315 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-641P-201 | ENST00000384006 | 107 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-190P-201 | ENST00000384154 | 102 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU2-68P-201 | ENST00000410878 | 191 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC114491.1-201 | ENST00000416095 | 246 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL160162.1-202 | ENST00000417654 | 244 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL080284.1-201 | ENST00000434493 | 442 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC092798.1-201 | ENST00000458542 | 409 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC022360.2-202 | ENST00000517308 | 407 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | UTP23-205 | ENST00000520733 | 369 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | NDUFAF4P1-201 | ENST00000559425 | 519 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC009145.3-201 | ENST00000567386 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | HMGN2P15-201 | ENST00000585707 | 270 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC023043.3-201 | ENST00000593113 | 385 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC174048.1-201 | ENST00000603389 | 144 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | BNIP3P9-201 | ENST00000603714 | 553 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTND4LP5-201 | ENST00000605152 | 292 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL121992.2-201 | ENST00000606262 | 256 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CNTN1 | Q12860 | AC099842.1-201 | ENST00000619919 | 596 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP003399.1-201 | ENST00000637534 | 361 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SENP7-205 | ENST00000394091 | 4434 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |