Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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