Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CPSF1Q10570 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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