Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms