Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms