Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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EHD3Q9NZN3 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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EHD3Q9NZN3 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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EHD3Q9NZN3 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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EHD3Q9NZN3 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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