Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHCHD3Q9NX63 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms