Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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