Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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FOXQ1Q9C009 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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