Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms