Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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TNXAQ16473 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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TNXAQ16473 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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TNXAQ16473 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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TNXAQ16473 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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