Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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