Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
USF2Q15853 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
USF2Q15853 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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