Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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