Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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