Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.59□□□□□ -2
MSLNQ13421 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
MSLNQ13421 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms