Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SP140Q13342 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SP140Q13342 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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